Bluesky's blog

Footsteps on my way!
perl/linux/测序分析

【今日观点】 R直接调用剪切版的内容

为了方便测试或者初步看看数据的图形展示,使用R时往往希望直接省去输入很长的文件路径,而直接从剪切版调用;方法整理如下: windows :   mf<-read.table(“clipboard”,sep=&# […]

Javaweb后台

Myeclipse 2016 CI 6 破解

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之前写了myeclipse 2015 stable 1.0/2.0的完美破解方法(详见 2015 stable 1.0 /2015 stable 2.0 ),反响不错,最近又花了一点时间收集了目前最新版的myeclipse 2016 ci […]

生物信息

edgeR使用

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最近把edgeR在Bioconductor上的pdf文档又看了看,其实之前也看过些。这里结合数据讲讲edgeR的使用(大部分是翻译文档,并梳理下利用edgeR分析数据的一般步骤,不足之处还望大家积极指出)。 edgeR包主要是用于利用来自不 […]

生物信息

cufflinks 输入文件排序

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cufflinks的输入文件是sam或bam格式。并且sam或bam格式的文件必须排好序(官方说需要按参考基因组位置排序)。Tophat的输出结果sam或bam已经排好了序。如果你用的是其他mapping程序,你可以用以下方法进行排序: 方 […]

生物信息

htseq-count的用法

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htseq-count 是一款用于reads计数的软件,他能对位于基因组上的一些单位的reads数进行统计,这里所说的单位主要是指染色体上的一组位置区间(我们常见的就是gene exon)。 *教程基于0.6.1p2版本 基本用法(软件安装 […]

JSP

一遍记住Java常用的八种排序算法与代码实现

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1.直接插入排序 经常碰到这样一类排序问题:把新的数据插入到已经排好的数据列中。 将第一个数和第二个数排序,然后构成一个有序序列 将第三个数插入进去,构成一个新的有序序列。 对第四个数、第五个数……直到最后一个数,重复第二步。 ![Uplo […]

生物信息

spike in 的意思

admin阅读(731)评论(0)

Spike:钉子 Spike-in:添加/加入(某种物质) Spike-in Control:添加/加入(某种物质)的对照(组) Dilution data:RNA稀释系列芯片数据, Spike-in data:Spike-in RNA是在 […]

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什么叫蓝海/红海/互联网思维?

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什么叫蓝海? 昨天在香格里拉门口停车,看见一个车位,这时有辆迈巴赫要停进车位。我走上前敲了敲他玻璃,甩出去一百块钱对他说:”这个车位我看中了,你去别的地方停!” 他觉得我小看他了,冲我脸上甩来十几张一百的叫我滚一边儿去。 后来,我又如法炮制 […]

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什么叫大数据?

admin阅读(523)评论(0)

某必胜客店的电话铃响了,客服人员拿起电话。 客服:必胜客。您好,请问有什么需要我为您服务? 顾客:你好,我想要一份…… 客服:先生,烦请先把您的会员卡号告诉我。 顾客:16846146***。 客服:陈先生,您好!您是住在泉州路一号12楼1 […]