Bluesky's blog

Footsteps on my way!
perl/linux/测序分析
生物信息

R plot 画指定颜色的散点图

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虽然是很简单的散点图,但有很多参数设置的地方,这里记录下来的原因主要是以下几点: 对不同的点分配不同的颜色 添加图例,并指定为多列 添加文本标注 示例数据: PC1 PC2 NC8C1 -0.208049 0.2023135 NC8C2 - […]

生物信息

R语言画多组数据相关性分析图

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相关性表示两组数据之间的关系是否“相似”或“相近”;但当遇到多组数据时,如何直观的比较各组数据之间的相关性是一个大家比较关注的问题,相关图可以通过对相关系数矩阵的可视化来解决这一问题。这里列出2种方法: 数据以R语言内置的mtcars数据框 […]

生物信息

PCA画图

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虽然很多R包都能做PCA,但如何将PCA结果最直观的呈现出来是一个很大问题,下面列举几种方法: 通过FactomineR包的PCA得到的结果,利用ggplot2画图 # Plotting the output of FactoMineR's […]

生物信息

一行R代码来实现繁琐的可视化

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本文作者: 唐源,目前就职于芝加哥一家创业公司,曾参与和创作过多个被广泛使用的 R 和 Python 开源项目,是 ggfortify,lfda,metric-learn 等包的作者,也是 xgboost,caret,pandas 等包的贡 […]