Bluesky's blog

Footsteps on my way!
perl/linux/测序分析
生物信息

NCBI的COG介绍

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什么是COG? “COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins(蛋白相邻类的聚簇)的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白,并且因此或者是orthologs或者是paralo […]

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戏说风投与融资

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编者按:今日,“古代有一小姐”刷遍“高大上”的金融圈,令小编不得不慨叹,中国人的智慧,在炒房与编段子这两件事上,真的是发挥得淋漓尽致。特整理于下,并欢迎大家开动想象力,在留言中跟帖,发挥出新的“小姐故事”。 1、古代有一小姐,遇到一个上京赶 […]

JSP

Eclipse导入spring

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spring官方下载: SPRING官方网站改版后,建议都是通过 Maven和Gradle下载,对不使用Maven和Gradle开发项目的,下载就非常麻烦,下给出Spring Framework jar官方直接下载路径: http://re […]

Javaweb后台

Myeclipse 2016 CI 6 破解

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之前写了myeclipse 2015 stable 1.0/2.0的完美破解方法(详见 2015 stable 1.0 /2015 stable 2.0 ),反响不错,最近又花了一点时间收集了目前最新版的myeclipse 2016 ci […]

生物信息

edgeR使用

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最近把edgeR在Bioconductor上的pdf文档又看了看,其实之前也看过些。这里结合数据讲讲edgeR的使用(大部分是翻译文档,并梳理下利用edgeR分析数据的一般步骤,不足之处还望大家积极指出)。 edgeR包主要是用于利用来自不 […]

生物信息

cufflinks 输入文件排序

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cufflinks的输入文件是sam或bam格式。并且sam或bam格式的文件必须排好序(官方说需要按参考基因组位置排序)。Tophat的输出结果sam或bam已经排好了序。如果你用的是其他mapping程序,你可以用以下方法进行排序: 方 […]

生物信息

htseq-count的用法

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htseq-count 是一款用于reads计数的软件,他能对位于基因组上的一些单位的reads数进行统计,这里所说的单位主要是指染色体上的一组位置区间(我们常见的就是gene exon)。 *教程基于0.6.1p2版本 基本用法(软件安装 […]

JSP

一遍记住Java常用的八种排序算法与代码实现

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1.直接插入排序 经常碰到这样一类排序问题:把新的数据插入到已经排好的数据列中。 将第一个数和第二个数排序,然后构成一个有序序列 将第三个数插入进去,构成一个新的有序序列。 对第四个数、第五个数……直到最后一个数,重复第二步。 ![Uplo […]