Bluesky's blog

Footsteps on my way!
perl/linux/测序分析

【今日观点】 R直接调用剪切版的内容

为了方便测试或者初步看看数据的图形展示,使用R时往往希望直接省去输入很长的文件路径,而直接从剪切版调用;方法整理如下: windows :   mf<-read.table(“clipboard”,sep=&# […]

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使用R绘制几种常用的双坐标轴图形

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之前公众号推送了一系列关于使用ggplot2包绘制统计图形的文章,有网友询问是否可以绘制双轴的统计图形。很抱歉,Hradly在设计ggplot2包时就没有将双轴图形功能考虑进来。难道R语言就无法绘制双轴图形了吗?非也,R不仅是统计学家的标准 […]

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R语言坐标轴标签倾斜

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R 语言画图函数本身没有提供坐标轴标签倾斜的函数,所以想要使坐标轴倾斜有两种方法: 1: 用原生R 只能自己屏蔽默认坐标轴,重绘一个自满足自己要求的坐标轴(以后整理),见方法: http://www.ats.ucla.edu/stat/r/ […]

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blast+ 使用方法

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BLAST+与BLAST比较 BLAST已经成为序列比对软件代名词,且其词性也已经开始变化,诸如BLASTing之类的词汇在各种论文中已是屡见不鲜,可见其影响之深,使用之广,如同分子生物学领域中的PCR。 自从1997年释出现有的BLAST […]

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safari不能上网但chrome能上

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可能是由于用了代理(蓝灯)的原因,退出代理后发现safari不能联网,然而chrome浏览器正常,通过上网查阅,发现可能是由于退出代理后,还有一些代理的相关任务没结束(自己的猜测),网上通过一条命令即可解决: sudo killall -9 […]

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permeabilized

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permeabilized cell 透性化细胞 一本书上说是‘渗透化’,用parafolmydehylde固定之后必须的一个步骤,否则一抗不能进入。 我的理解:permeabilized 透性化处理,使膜通透性增强,便于抗体染色,下面这个 […]

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什么是multiplicity of infection (MOI)

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multiplicity of infection(MOI)中文译为多重感染或者感染复数。传统的MOI概念起源于噬菌体感染细菌的研究。MOI其含义是感染时噬菌体与细菌的数量比值,也就是平均每个细菌感染噬菌体的数量。噬菌体的数量单位为pfu。 […]

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初品BioPerl(第六篇:对象的类型)

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时常听到有人说,XXX语言是面向过程的,而XXX语言是面向对象的……我认为这种说法不是很妥当,面向过程和面向对象只是一种编程的思路而已,和具体的编程语言无关。Perl应该算是一种面向过程的语言(它可以写得很像C的风格,虽然我不大喜欢),但如 […]