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perl/linux/测序分析

蛋白质组数据ID解析

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蛋白组数据得到的ID的具体意思是什么?通过比较发现ID是来自于uniport的ID,具体如下: swissprot|primary acc#|entry name   sp代表 swissprot tr代表 trEMBL unip […]

将uniport ID转换将 ensemble ID

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在做蛋白质组和转录组分析的时候,难免需要将蛋白ID(uniport ID)或 基因ID(ensemble ID或者refseq ID或GI number等),uniport 提供了专门的ID转换工具:uniport ID mapping s […]

ggplot x轴排序

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今天在用R绘制多组boxplot时碰到一个问题:如何自定义boxplot各组的输出次序? 问题描述: ups<-read.delim(“e:\\test.txt”); ups.melt<-melt(ups […]

R plot 画指定颜色的散点图

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虽然是很简单的散点图,但有很多参数设置的地方,这里记录下来的原因主要是以下几点: 对不同的点分配不同的颜色 添加图例,并指定为多列 添加文本标注 示例数据: PC1 PC2 NC8C1 -0.208049 0.2023135 NC8C2 - […]

R语言画多组数据相关性分析图

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相关性表示两组数据之间的关系是否“相似”或“相近”;但当遇到多组数据时,如何直观的比较各组数据之间的相关性是一个大家比较关注的问题,相关图可以通过对相关系数矩阵的可视化来解决这一问题。这里列出2种方法: 数据以R语言内置的mtcars数据框 […]

ggplot2报错

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Error: could not find function “opts” > library(ggplot2) > facebookData <- read.delim("FacebookNarc […]