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perl/linux/测序分析

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生物信息

蛋白质组数据ID解析

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蛋白组数据得到的ID的具体意思是什么?通过比较发现ID是来自于uniport的ID,具体如下: swissprot|primary acc#|entry name   sp代表 swissprot tr代表 trEMBL unip […]

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T细胞成员大阅兵

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T细胞通过直接分泌可溶性细胞因子或通过细胞接触依赖机制在免疫应答和功能中起重要作用。许多T细胞亚群的特征已被明确。尽管效应T细胞最初被认为是终末分化的,但越来越多的证据已经挑战了这一观点,并且表明效应T细胞的表型不是完全固定的,而是更灵活或 […]

生物信息

ggplot x轴排序

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今天在用R绘制多组boxplot时碰到一个问题:如何自定义boxplot各组的输出次序? 问题描述: ups<-read.delim(“e:\\test.txt”); ups.melt<-melt(ups […]

生物信息

R plot 画指定颜色的散点图

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虽然是很简单的散点图,但有很多参数设置的地方,这里记录下来的原因主要是以下几点: 对不同的点分配不同的颜色 添加图例,并指定为多列 添加文本标注 示例数据: PC1 PC2 NC8C1 -0.208049 0.2023135 NC8C2 - […]

生物信息

R语言画多组数据相关性分析图

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相关性表示两组数据之间的关系是否“相似”或“相近”;但当遇到多组数据时,如何直观的比较各组数据之间的相关性是一个大家比较关注的问题,相关图可以通过对相关系数矩阵的可视化来解决这一问题。这里列出2种方法: 数据以R语言内置的mtcars数据框 […]