杨李的文章

conda使用注意事项

2018-06-15杨李阅读(64)评论(0)

在Linux里面有一个巨大的梦魇就是软件包之间的依赖关系, 安装软件的时候各种依赖库找不到, 很让人抓狂.好消息是不同的Linux发行版提提供各自的依赖管理系统, apt/yum是目前比较常见的管理工具. 如果你有管理员权限, 你能够非常开 […]

2018-06-14杨李阅读(43)评论(0)

conda的确是一个非常好的工具，对于初学者而言，安装软件就跟用apt/yum软件管理器一样方便。但软件安装后有时会出现的动态库缺失的问题。以安装软件lefse（https://bioconda.github.io/recipes/lef […]

2018-06-14杨李阅读(50)评论(0)

conda是一个能运行于windows/mac os/linux的基于python开发的开源包管理器，他能很方便快捷的安装，运行，更新软件及其依赖。并且能够轻松的创建，保存，加载或切换conda管理的软件环境，从而摆脱没有root的烦恼。 […]

2018-05-18杨李阅读(95)评论(0)

运行软件ARC（http://ibest.github.io/ARC/#ARCInstallation）时报错如下： -bash-4.2$ ./ARC > log.txt rm: 无法删除"/share/workdir/yangtt/ […]

2018-05-18杨李阅读(85)评论(0)

centos 7 yum由于更新了(Python 2.7.5 => Python 2.7.15)后，安装软件时报错： [root@localhost ~]# yum install sqlite-devel 已加载插件：fastest […]

2018-05-18杨李阅读(226)评论(0)

pip在python3中是自带的，而在python2中需要自行安装，安装步骤见：http://yangl.net/2018/05/18/centos7_install_python2/ 1. pip安装的包路径一般默认路径为： [pyt […]

2018-05-18杨李阅读(100)评论(0)

虽然centos自带python2,但是一般没有pip包管理器，并且命令yum是调用这个python(看yum的源码，开头就是 #! /bin/usr/python)的。所以如果随意修改python版本可能导致yum命令无法使用。所以要将y […]

2018-05-15杨李阅读(137)评论(0)

在运行bedtools时报错如下： [root@localhost ~]# bedtools bedtools: /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.20' not found (req […]

2018-05-10杨李阅读(291)评论(0)

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2018-05-07杨李阅读(235)评论(0)

记录一下R的安装过程，服务器系统版本为centos 7，R版本为最新版3.5.0。下面是安装步骤： wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-对应版本号.tar.gz 解压文件：tar – […]