Bluesky's blog

Footsteps on my way!
perl/linux/测序分析

【今日观点】 柱状图连续颜色填充

画一个柱状图,每个柱的颜色是类似于heatmap图一样的连续的颜色 数据: activation of cells 46 3.512 activation of macrophages 16 2.519 activation of phag […]

生物信息

蛋白质组数据ID解析

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蛋白组数据得到的ID的具体意思是什么?通过比较发现ID是来自于uniport的ID,具体如下: swissprot|primary acc#|entry name   sp代表 swissprot tr代表 trEMBL unip […]

生物信息

ggplot x轴排序

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今天在用R绘制多组boxplot时碰到一个问题:如何自定义boxplot各组的输出次序? 问题描述: ups<-read.delim(“e:\\test.txt”); ups.melt<-melt(ups […]

生物信息

R plot 画指定颜色的散点图

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虽然是很简单的散点图,但有很多参数设置的地方,这里记录下来的原因主要是以下几点: 对不同的点分配不同的颜色 添加图例,并指定为多列 添加文本标注 示例数据: PC1 PC2 NC8C1 -0.208049 0.2023135 NC8C2 - […]

生物信息

R语言画多组数据相关性分析图

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相关性表示两组数据之间的关系是否“相似”或“相近”;但当遇到多组数据时,如何直观的比较各组数据之间的相关性是一个大家比较关注的问题,相关图可以通过对相关系数矩阵的可视化来解决这一问题。这里列出2种方法: 数据以R语言内置的mtcars数据框 […]