Bluesky's blog

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perl/linux/测序分析

【今日观点】 水木男孩:清华计算机96级同学们的异样人生

1998年的清华大学,9号楼一层的男生宿舍和7号楼二层的女生宿舍之间拉起了一根网线。网线的这一头的周枫,那一头是庄莉。 这根网线除了让两人不出宿舍门,不花电话费就能互诉衷肠,还让清华大学男女宿舍都连上了计算机系开发的校园BBS,酒井(9#) […]

生物信息

Gene Ontology (GO) 简介

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http://www.geneontology.org/ 我将从下面几个测度介绍一下Go: 1.GO怎么就出现了? 现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因:不光是精确的计算机难以搜寻到这 […]

生物信息

GO数据库下载

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首先要明白,需要下载什么? 要下载四万多条GO记录的详细信息(http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo) 要下载GO与GO之间的关系(http://archive.geneontology […]

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水木男孩:清华计算机96级同学们的异样人生

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1998年的清华大学,9号楼一层的男生宿舍和7号楼二层的女生宿舍之间拉起了一根网线。网线的这一头的周枫,那一头是庄莉。 这根网线除了让两人不出宿舍门,不花电话费就能互诉衷肠,还让清华大学男女宿舍都连上了计算机系开发的校园BBS,酒井(9#) […]

生物信息

蛋白质组数据ID解析

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蛋白组数据得到的ID的具体意思是什么?通过比较发现ID是来自于uniport的ID,具体如下: swissprot|primary acc#|entry name   sp代表 swissprot tr代表 trEMBL unip […]

生物信息

将uniport ID转换将 ensemble ID

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在做蛋白质组和转录组分析的时候,难免需要将蛋白ID(uniport ID)或 基因ID(ensemble ID或者refseq ID或GI number等),uniport 提供了专门的ID转换工具:uniport ID mapping s […]

生物信息

ggplot x轴排序

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今天在用R绘制多组boxplot时碰到一个问题:如何自定义boxplot各组的输出次序? 问题描述: ups<-read.delim(“e:\\test.txt”); ups.melt<-melt(ups […]